Решение о создании храмового комплекса было принято в 2014 году, в период образования Норильской епархии. Храм назван в честь канонизированных новомучеников и исповедников: в прошлом столетии на территории Норильского промышленного района располагался Норильский исправительно-трудовой лагерь, в котором находилась четвёртая часть всех репрессированных граждан СССР.
Освящение закладного креста под строительство храма совершено самим Патриархом Кириллом в 2015 году. Средства на возведение объекта выделены компанией ПАО «Горно-металлургическая компания «Норильский никель».
Храмовый комплекс включает музей, посвящённый репрессированному духовенству, библиотеки для детей и взрослых, помещения для работы с молодёжью, а также места для временного проживания выпускников духовных школ из других городов, направленные на служение в Норильскую епархию.